北醫質子中心於民國111年正式啟用，北醫體系質子系統是全臺首座超導型質子治療機，體積較小的優勢及全球少見的全地下化建築，成為首座座落於都會區的質子治療中心，減少癌症病人舟車勞頓，大幅提升就醫便利性；先進的質子治療也全面提升北醫體系的癌症醫療水準，邁向國際一流的全方位癌症治療中心。
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顱顏中心是106年10月全新成立的特色醫療中心，整合外科、牙科、耳鼻喉科、復健科、兒科與精神科等多科別，為顱顏病患提供全方位的醫療服務。 顱顏異常如唇顎裂、半邊小臉症、顱縫早閉或齒顎問題的病患，在成長過程往往會面臨餵食、美觀、語言發展、咬合不正、蛀牙、顏面骨發育不良、中耳炎、鼻炎、心理發展、社會適應等多重挑戰。 顱顏中心提供病患專業的醫療協助以及心理層面的輔導，希望在台灣打造一所顱顏患者的美麗殿堂。
衛福部於2018年9月公布「特管辦法」開放細胞治療，本院於2018年12月24日獲准為免疫細胞治療臨床試驗醫院，2019年1月10日成立細胞治療中心，同年11月15日經衛福部核准，為特管法開放以來的第六例合格案件也是全台第四家可以執行細胞療法的醫院，預期將嘉惠更多病患，同時為北醫附醫後續多樣細胞治療的開發打了一劑強心針。
本中心擁有優秀醫師、專業諮詢護理師以及經驗豐富的實驗室技術員，多年來不斷研究創新及開發新技術，提供不孕婦女優質手術治療技術，並得到最佳治療效果。每年試管嬰兒的治療週期超過2000例，成功率達40%，是台灣生殖醫學中心的領導者。中心的專業服務：著床前基因篩選及診斷（PGS／PGD）、冷凍精液及卵子、人工授精、試管嬰兒、子宮內膜異位症手術及治療。
臺北醫學大學附設醫院本著關懷女性的宗旨，為讓女性朋友在接受乳房檢查時能有「安全、隱密、溫馨、舒適」的檢查環境、尊重個人隱私及提供優質乳癌治療團隊而於2015年7月成立乳房醫學中心。中心內有乳房外科專用診間及寬敞候診區，超音波檢查室備有新型高階乳房超音波儀器，同時中心也設有乳房粗針切片、細針細胞穿刺專用檢查室以提供方便、快速檢查流程。
如果您有體重過重的問題，這裡是一個充滿專業及溫馨的體重園地，不論是手術減重(如水球、胃束帶、胃繞道、袖狀胃切除)、飲食減重、藥物減肥，以及運動瘦身，我們永遠可以為您帶來最豐富的資訊。
1.個人化:在北醫，健檢不僅提供基本的身體檢查，更精確的瞭解您真正的需求，上百位不同專長，醫學中心資歷的專業醫生，為每一個獨特的身體，量身打造適切的檢查需要，並有專人全程親切服務，專業健康管理師幫您做好完善轉介與追蹤及治療建議。 2.高科技:為了精準掌握任何可能的微小病灶，我們提供頂尖的高科技設備：包括 超高陣列雙球管電腦斷層(DSCT)、全身型正子攝影(PET)、全身磁振造影（whole body MRI）及各式超音波等，配合豐富經驗的醫師為您的身體嚴密把關。 3.整合:我們瞭解身體是上帝創造最精密的藝術品，每一個微小的變化都足以影響整體的狀態，為了不遺漏任何訊息，我們集結了全院的各科優秀醫生跨科診療，並結合睡眠中心、傳統養生及經脈診治等中西醫檢測，讓您安心、放心。 4.舒適:在北醫，健診是一種優雅的生活假期。我們貼心為您準備了獨享北市菁華景觀的專屬樓層，確實醫檢分離保障您的隱私，提供健康餐飲並備置商務中心、會議室、無線網路，讓您的商務不斷線。
北醫附設醫院自99年起由癌症中心擴大為癌症醫院，以『專屬之個人化』治療為遠景，網羅國內外知名學者專家及中央研究院院士，致力於提供先進的癌症診治技術，帶給癌症病人不同的選擇。 除以往達文西手術、螺旋刀及中西醫整合醫療外， 更圖擴展與日本兵庫縣重粒子治療之合作治療合約，和引進磁振導航超音波熱治療以有效改善骨轉移疼痛及引進美國希望之城『領航師系統』，提供癌友專屬而全方位的照護服務。
位處於最國際化的台北101信義商圈，我們秉持「守護皮膚健康、醫美就要自然」，多位國外進修美容專科的皮膚科專家，不斷引進頂尖的雷射光療、無創拉皮技術，歐美優質原廠的微整形針劑，在美白除斑、除皺、塑臉、緊緻拉提、除疤、除毛、護膚等美容醫學專業上備受肯定。整形外科專家團隊，也提供各式精巧美容整形手術。當您準備好便美的那一刻起，走進時尚雅緻的北醫美容醫學中心，本中心全體醫療團隊，將認真聆聽您的需求，安排屬於您的美麗計畫。
北醫血友病中心於2007年8月設立，提供血液凝固障礙疾病(包括血友病、類血友病)的診斷與治療，並提供國內血友病友一流的醫療照顧，藉著建立堅強的整體醫療(Comprehensive Care)團隊，包括血液科、骨科、復建科、物理治療師、牙科等團隊，並發展以病人為中心的血友病醫療照顧；本中心提供高可近性的舒適便利就醫環境，並與國際血友病醫療接軌。使血友病中心成為診斷、評估、治療、與醫療資源的平台，協調聯絡跨科部的照護，以提供整體性醫療照護教育的功能。
聯檢中心位於第三醫療大樓6樓，102年8月1日正式成立，依循本院建立安全就醫環境為理念，以病人為中心提供優質的專業技術與服務品質。現階段聯檢中心包含五大功能檢查:心臟功能檢查室、神經功能檢查室、肺功能檢查室、超音波暨內視鏡檢查室、支氣管鏡檢查室等。結合各醫療專科醫師技術，具備新穎之醫療儀器及獨立隱密的檢查空間，提供完整且準確的檢查。
國際病人中心除了專人服務外尚結合完整醫療團隊，提供病患到院就醫前後相關之醫療服務，其中包含從前置作業之專業醫療諮詢、行程及住宿安排，到後續醫療報告及追蹤，本院均提供全方位的國際醫療團隊做專屬服務及照護。
為因應老年化導致的全球趨勢，慢性疾病的長期照顧和自我管理成為醫療健康產業的重要課題。物聯網、資通訊科技產品等新興技術於醫療健康領域廣泛應用，已成為輔助健康照護需求的重要解決方案。「遠距健康照護」是結合醫療專業、健康照護、資通訊技術、電子化醫療器材…等跨領域的服務模式，讓民眾在熟悉的社區與居家環境中，透過系統化的資訊平台與24小時營運的健康照護客服中心，打破空間與時間的限制，隨時隨地獲得樂活養生、預防保健、疾病管理的專業客製化服務。