秘書室是秉持著醫院以病家為尊、以同仁為重、以北醫為榮的核心價值，以作為一個稱職的院長室幕僚單位為目標。不管是在醫院的經營管理、公共事務推廣、院內控制及稽核以及策略規劃的溝通，希望透過秘書室的整合規劃，讓病家、同仁對醫院提供的服務與推行的政策更加清楚明確。以達到以病人為中心的優質醫療團隊。

本室架構中設有秘書組、公共事務組、企劃組、績效組、經營分析組及稽核組共六組，單位同仁合計28位。醫院管理日新月異，本室同仁均具有管理的專才，期待本室每一位皆能以新、速、實、簡的工作態度，提供給大家更精緻的服務。也希望能協助坐落在台北一隅的附設醫院，提供更優質的專業醫療，服務更廣大的民眾。悠悠服務40年，發光發熱再40年！