消化內科又稱肝膽腸胃科，所診治疾病的範圍包括食道、胃、小腸、大腸、肝臟、膽囊、胰臟及脾臟等器官。

本院消化內科乃是台灣消化系醫學會及台灣消化系內視鏡醫學會所指定的專科醫師訓練醫院，目前有13位專任主治醫師，其中5位醫師為消化系醫學會及消化系內視鏡醫學會之指導老師。

每位醫師均擅長其專業領域的疾病，擁有優異且熟練的技術；科內技術員必須具備急救加護經驗及證書並定期舉辦在職教育。

北醫附設醫院也積極地安排年輕主治醫師出國受訓及吸收新知,並且經常邀請國際知名學者至本院參訪演講教學相長，持續醫學教育。